少林寺是一个只有男性主角才能加入的门派,新手刚加入后会统一拜清无为师,这时只能学习门派的一般功法。从这个导师出师后有三个堂口可以选择,这里需要谨慎考虑,因为一旦选好后很难再去其他的堂口。每个堂口的镇派武学都是固定的,学完一个堂口的功法后需要转换堂口需要通过十八铜人阵的考验。这个阵法需要有很高的战力才能通过,因此前中期的玩家基本不考虑转换,最好在一开始就选好。
其中罗汉堂的镇派武学有两种,想要学习大光明神拳这个拳法的话需要去拜伏虎罗汉为师,学习达摩八法神禅杖这个棍法的话要去拜降龙罗汉为师。波若堂也有两个罗汉可以拜师,可以和他们学习的进阶武学有所不同,但是最终的镇派武学都是波若禅掌。菩提院的镇派武学是无相劫指,但是这个堂口可以把经络学学习到满级,没有选择这个堂口的弟子最多只能学到100级。除了三个武学堂口外还有一个戒律堂,它主要负责弟子的纪律问题,加入少林寺的初期有很多事不能做否则会增加破戒值。
另外一旦加入这个门派会强制剃头,如果通过使用特殊发型让自己有了头发后不能靠近戒律堂的执法僧人,否则会再次强制剃头。在成为玄字辈的弟子之前探索江湖时不能喝酒或者宰杀动物,这两种行为都会增加破戒值。破戒值在20点以下时去戒律堂里接受一次口头警告就可以让它清零,20点以上到60点以下需要去戒律堂进行面壁思过,期间每五秒才能减少两点破戒值。高于60点的话会被惩罚并获得一个负面效果,让玩家在接下来两小时的攻击和防御大幅降低。进阶到玄字辈弟子后不会再有破戒值,但是在进阶前建议把破戒值清零,因为会降低功德值。
少林寺有很多可以增加实力的技艺和秘技,玩家可以选择适合自己的去学习,其中比较适合优先学习的是经络学和铁布衫。经络学可以让丹田凝聚真气的速度加快并提升丹田容量,玩家可以更快冲击经络上的窍门。铁布衫可以增加前排弟子的防御和气血,让队伍在打副本和过关时更容易。少林寺拥有素斋和药浴两种福利,玩家每天可以领取一份可以增加体力的素斋。药浴可以增加主角的多种属性,但是每次去泡药浴需要消耗甘草和功德值。