命令与征服3:泰伯利亚战争的故事背景设定在2047年,延续了系列主线剧情,围绕神秘外星矿物泰伯利亚的争夺展开。第三次泰伯利亚战争爆发,地球已被泰伯利亚严重侵蚀,全球分为蓝区(轻度污染)、黄区(中度污染)和红区(重度污染)。GDI(全球防御组织)与Nod兄弟会再次因资源控制权爆发冲突,而外星种族Scrin的突然介入使局势更加复杂。
Nod兄弟会领袖凯恩在第二次泰伯利亚战争后蛰伏多年,重新现身并策划了一场针对GDI太空防御系统的突袭。他摧毁了GDI的轨道防御网络,导致GDI太空总部费城空间站被Scrin舰队摧毁。这一事件成为战争转折点,Scrin以收割者姿态降临地球,表面目的是采集泰伯利亚,实则隐藏着更深的阴谋。凯恩则利用Scrin的科技试图实现升天计划,将人类进化至更高形态。
GDI在战争初期陷入被动,但很快调整战略,一方面抵御Scrin的进攻,另一方面试图夺回被Nod占领的泰伯利亚控制节点。剧情通过双线叙事展开:GDI战役聚焦于收复失地与对抗外星威胁,而Nod战役则揭示凯恩的真实目的——利用Scrin技术激活全球泰伯利亚矿脉,制造通天塔以实现跨维度跃迁。双方在战役中均面临道德抉择,例如是否牺牲平民区域以阻断Scrin的能源供应。
游戏通过数据库条目和过场影片暗示,泰伯利亚实为Scrin播种的生物武器,其扩散会逐步改造地球环境以适应外星殖民。然而凯恩的反击计划意外打乱了Scrin的节奏,最终GDI摧毁了Scrin的界限之塔,迫使外星势力撤退。但战争并未结束,凯恩在结局中带着Scrin科技消失,为续作埋下伏笔。
剧情核心始终围绕泰伯利亚的双重性展开——它既是毁灭文明的灾祸,也是推动人类进化的钥匙。游戏通过多阵营视角呈现了战争的全貌,并延续了系列标志性的真人过场影片,强化了叙事沉浸感。尽管Scrin的威胁暂时解除,但泰伯利亚的蔓延与凯恩的未竟计划,仍为世界观留下了深刻的悬念。